Senior ML Research Engineer

Apheris - Näin toimimme Apherisissa rakennamme tulevaisuutta sillä, miten tekoälyä sovelletaan lääke­kehityksessä ja tutkimuksessa. Mahdollistamme johtavien lääkeainetuotteiden löytämisen ja kehittämisen nopeammin. Isännöimme alan suurimpia federoituja dataverkkoja lääkeaineiden tutkimus-AI:ssa, jotka kattavat ko-folointia, ADMET:iä ja vasta-ainotuotannon kehitystä. Näiden verkkojen kautta mallit opetetaan omistajayritysten omilla dataset-sillä saavuttaen paremman suorituskyvyn ja laajemman sovellettavuuden samalla kun tietosuoja ja IP pidetään turvattuna. Roolin kuvaus Etsimme Senior Machine Learning Research Engineeria auttamaan molekyyli- ja rakenteellisen biologian ML-mallien tutkimus- ja kehitysprosessissa. Tämä on käytännön rooli, jossa yhdistyvät perusmallien, rakenteellisen biologian ja federated learningin rajapinnat. Suoritat tutkimushankkeita, muuttaen tieteelliset tavoitteet edistyksellisiksi ML-malleiksi, joita voidaan arvioida, julkaista ja hyödyntää todellisessa lääkeaineiden suunnittelun työμuodossa. Tehtävät Kehitä ja paranna ML-malleja molekyylibiologiassa ja rakenteellisessa biologiassa, kuten ko-folding ja sidossitoutumisen affiniteti-mallit, lääkekehitys-sovelluksissa ja työnkuluissa, ideoinnista prototyyppiin ja vankkaan työkalupakkiin asti. Rakenna tehokkaita benchmarkingi- ja arviointistrategioita mallien arviointiin ja kehitä mallejasi datalähtöisesti. Diagnosoi ja korjaa datalaatuun sekä putkistoon liittyviä ongelmia, jotka vaikuttavat mallin laatuun. Pysy ajan tasalla nopeasti kehittyvästä tutkimuskirjallisuudesta ja tunnista parhaat julkiset lähestymistavat tutkimuksen ja kehityksen tueksi. Yhteistyö asiakkaiden, kumppaniohjelmien insinöörien ja ulkopuolisten yhteistyökumppanien kanssa todellisten lääkekehityksen käyttötapauksissa. Mitä odotat sinulta Sinulla on tohtorin tai MSc-tutkinto koneoppimisesta, laskennallisesta biologiasta, laskennallisesta kemiasta, bioinformatiikasta, fysiikasta tai alaan liittyvästä kentästä sekä vähintään 2 vuotta ammatillista ML-käytäntöä tieteellisten ongelmien ratkaisemiseksi. Sinulla on käytännön kokemusta syvällisten oppimismallien kouluttamisesta, hienosäädöstä ja laajentamisesta molekyylitieteen/parin rakenteiden mallintamiseen. Osaat tutkia ML-malleja, niiden koulutusta ja tieteellisiä benchmarkingeja kriittisesti ja muuttaa oivalluksia merkittäviksi parannuksiksi. Olet asiantunteva Pythonissa ja PyTorchissa, voit tuottaa luotettavaa ja siistiä koodia ja hallitset monigpu- sekä hajautetun koulutuksen. Sinulla on syvällinen perehtyneisyys rakenteelliseen biologiaan sekä proteiini–ligandi-dataformaattiin, laatumittareihin ja työkaluihin. Proaktiivisesti etsit mahdollisuuksia tieteelliseen panostukseen organisaation tavoitteiden vaikuttamiseksi. Mielellään omaat kokemusta federated learningista, tietosuoja-ML:stä tai turvallisesta mallikoulutuksesta. Sinulla on kokemusta ML-mallien kehittämisestä lääkeaineiden suunnitteluun lääke- tai bioteknologia-ympäristöissä. Olet julkaissut huippuluokan ML- tai rakenteellisen biologian julkaisuihin tai osallistunut avoimen lähdekoodin projekteihin. Mitä tarjoamme sinulle Teollisesti kilpailukykyinen palkka, mukaan lukien varhaisen vaiheen virtuaaliset optiot Remote-first työskentely – työskentele missä parhaiten tunnet itsesi, oli kyseessä kotona tai coworking-tilassa lähelläsi Erinomainen valikoima etuja, mukaan lukien hyvinvointibudjetti, mielenterveyden tuki, etätyöbudjetti, coworking-tuki ja oppimisen ja kehityksen budjetti Suurikokoinen lomaoikeus Toimistopäivät Berliinissä HQ:ssa tai toisessa Euroopan sijainnissa (3 kertaa vuodessa) Hauska, monipuolinen tiimi, jolla on kokemusta johtavista organisaatioista ja tavoitteena käyttää AI:ta ja ML:ää hyvään